我國棉花害蟲種類繁多，據報道有300多種，造成危害的有20～30種，年發生面積都在2億畝次以上，防治面積在3億畝次以上。自上世紀90年代以來，由于生態、氣候、品種等變化，特別是在黃河流域、長江流域棉區，轉Bt基因棉的大面積種植，棉鈴蟲等鱗翅目害蟲得到有效控制，但棉蚜、棉葉螨、棉盲蝽、棉粉虱等刺吸式害蟲的發生卻日趨加重，對棉花生產影響很大。目前，由于農民超劑量、盲目用藥普遍，加速了棉花害蟲抗藥性上升的速度，棉蚜已經對菊酯類藥劑產生了極高的抗性，最高達到數千甚至上萬倍；對新煙堿類藥劑吡蟲啉抗性達到了500倍以上；棉鈴蟲對擬除蟲菊酯類藥劑抗性仍然是居高不下，而且對轉Bt基因棉的抗性有逐年上升趨勢。　　

    棉蚜：發生通常有兩個高峰期，分別為苗蚜和伏蚜發生期。苗蚜防治可以采用種子拌種或莖葉噴霧，種子拌種可選用吡蟲啉、噻蟲嗪；莖葉噴霧防治苗蚜，可選用丁硫克百威、吡蟲啉、烯啶蟲胺。伏蚜防治可選用啶蟲咪、噻蟲嗪或者氧化樂果。　　

    棉盲蝽：7～8月份是棉盲蝽高發期，前期防治可選用馬拉硫磷、高效氯氟氰菊酯；中期可選用阿維菌素或甲維鹽、硫雙威；后期防治使用啶蟲咪、吡蟲啉等。　　

    棉葉螨：從5月下旬至8月中下旬是棉葉螨發生期，通常有2～3個發生高峰。前期防治可選用雙甲脒、唑螨酯、噠螨靈；中后期防治可選用阿維菌素、炔螨特、螺螨酯。　　

    棉鈴蟲：6月份防治可選用高效氯氟氰菊酯、氟氯氰菊酯、辛硫磷、丙溴磷、氟鈴脲；7月份防治可選用硫雙威、多殺菌素；8月份防治可選用阿維菌素、甲維鹽、茚蟲威。　　

    棉薊馬：棉花苗期和花鈴期發生比較重，防治棉鈴蟲的藥劑均能起到兼治作用。如需單獨防治，第一次防治可選用高效氯氟氰菊酯；第二次防治可選用毒死蜱或阿維菌素。