棉花苗期病害主要有立枯病、炭疽病、紅腐病等，主要防治措施有以下幾點：
1、精選種子，用種衣劑包衣：選擇不帶病菌，成熟度好的棉種，在播種前選用適合當地的種衣劑對種子進行包衣，選晴天曬7天左右，增加后熟，提高出苗率和出苗速度，減少病害發生。
2、適時播種：以5厘米深土溫達12℃時為適宜播期，播深2-3厘米為宜。
3、加強苗期管理：①適當早間苗、勤中耕，降低土壤濕度，提高土溫，培育壯苗。②苗期噴藥防治：棉花出苗后噴灑50％多菌靈或70%甲基托布津可濕性粉劑800倍液+70%代森錳鋅600倍液。
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