旱育秧的苗床是經過嚴格培肥的，其供肥總量充足，養分全面，速效肥料含量高，所以，在秧苗生長前期一般不會缺肥。但由于苗床處于相對干旱半干旱狀態和秧苗前期蒸騰量小，養分在苗床上的移動性差和肥料營養元素在秧苗體內運輸不暢，均易造成變相缺肥。隨著葉齡的增加，地上莖、葉、蘗的生長量不斷增加，所需營養元素也不斷增加。后期往往出現旱育秧落黃脫力的癥狀，這時必須適時適量追肥。旱育秧與濕潤育秧不同，在追肥時應注意以下4點：
（1）旱育秧的葉色一般比較深綠，缺肥初期不易察覺，當葉片出現落黃時，表面缺肥程度比同葉色的濕潤秧苗重。
（2）旱育秧施用肥料種類應考慮到苗床干燥的特點，以選用優質尿素最佳，不能施用易揮發性的其他肥料。不能直接撒施，防止局部肥料濃度過高，灼傷葉片或燒苗，應采用肥水噴澆的方式。若化肥直接撒施，必須于撒施后立即噴水淋洗。
（3）旱育秧缺肥是由缺水引起的，所以在追肥時，一次用肥不宜過多，每 1米 2用尿素5～10克，兌成1%的尿素液噴澆，可避免燒苗，以水帶肥入土，提高肥效。
（4）澆肥液和澆水一樣，時間上要在傍晚追肥，最好與補水同時進行，追肥的次數、用肥量和用水量要嚴格控制，以防削弱旱育秧的生理優勢。
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