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古老棉種蓬蓬棉的基因組分化特征被揭示

放大字體  縮小字體 發布日期:2021-06-10  來源:中國農業科學院棉花研究所  作者:何守樸  瀏覽次數:333
 
  近日,中國農業科學院棉花研究所棉花資源創新利用創新團隊利用遺傳學和全基因組關聯分析等方法,系統地研究了一種在我國南方的多個海島生長了數百年的陸地棉多年生半野生棉——蓬蓬棉,揭示了其進化地位,為拓寬陸地棉遺傳多樣性提供了理論依據和材料基礎。相關研究結果發表在《遺傳學與基因組學雜志(Journal of Genetics and Genomics)》上。
 
  據團隊首席杜雄明研究員介紹,陸地棉是世界上栽培最廣的棉種。目前,公認的7個陸地棉半野生棉均分布在中美洲地區。蓬蓬棉是多年生陸地棉半野生棉,常見于我國南方的多個海島,其在當地四季都開花,也被稱作“四季棉”。因蓬蓬棉種質資源稀少而缺乏系統研究,其進化地位也未得到確認。自2010年起,在科技部基礎性工作專項等項目的大力支持下,團隊經多次實地考察,從我國廣東硇洲島和特呈島、海南島和西沙群島等地區共搜集蓬蓬棉種質46份。
 
  該研究通過分析蓬蓬棉、中美洲半野生棉和現代栽培種群體的基因型發現,蓬蓬棉是一個相對古老的陸地棉半野生棉,可能是數百年前地理大發現時代隨全球貿易商船或洋流運動傳入我國境內。群體比較結果表明,蓬蓬棉基因組上攜帶一些特殊單體型區段,與中美洲陸地棉半野生棉和現代栽培種均存在差異,這些染色體區段對重新認識陸地棉在我國的引進和馴化歷史,進一步拓展現代栽培陸地棉的遺傳多樣性具有重要意義。該研究還利用蓬蓬棉光周期敏感、纖維產量低和品質差等特性,利用全基因組關聯分析方法鑒定到大量與開花期、纖維產量和纖維品質相關的SNP標記,這些標記所在的單體型區間為進一步發掘相關性狀功能基因奠定了重要基礎。
 
  該研究得到了“十三五”國家重點研發計劃和農業農村部種質資源保護專項等項目的資助。(通訊員 梁冰)
 
  原文鏈接://doi.org/10.1016/j.jgg.2021.04.009
 
 
 
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