1、控制種子水份含量
種子入庫之前，含水量必須降到14%以下，如含水量過高，種子就要受到高溫危害和低溫凍害，部分或全部喪失發芽能力。
2、控制種子的純度和凈度
牧草種子中如含有較多的不成熟或破碎的種子，以及其他大量塵土雜質等，都會給種子安全貯藏帶來不良后果。所以，在貯藏中一定要注意保持種子的純度和凈度。
3、種子庫通風防濕
達到上不漏雨雪、下不潮。要把裝有種子的麻袋或其他容器用木料或磚墊離地面50厘米以上。室內要保持干燥、通風良好。種子堆放量大時要經常進行人工通風，使種子經常處在干燥的狀態中。
4、選擇好牧草種子袋
不要用塑料袋裝草種，因為塑料袋不透氣，種子呼出的二氧化碳無法排出，容易造成二氧化碳中毒。另外，種子本身的水份和呼吸作用所產生的熱量散發不出去，易造成種子發熱霉變。也不要用化肥袋裝種子。要用通透良好的紙袋或麻袋等裝種子。
5、注意牧草種子庫房的整潔
不要把牧草種子和農藥、氮素化肥放到一起保存，因為有些農藥對種子有毒害作用，不但影響種子的發芽率，也可使牧草種子發生生理變化，種植后可出現不正常現象。氮素化肥揮發出來的氨氣有很強的腐蝕作用。
6、定期檢查
（1）檢查種子是否受潮。
（2）檢查種子是否被蟲蛀鼠咬。
（3）定期檢查種子的發芽率主發芽勢。
