降低菇房溫度和濕度，加大通風量，并用草木灰覆壓霉菌處，防止霉菌孢子飛揚傳播。先用3%的來蘇兒溶液或3%的甲醛溶液室內噴熏，再用1%的高錳酸鉀溶液清洗霉菌處。在霉菌處撒上高錳酸鉀顆粒后，噴水于霉菌外圍。取生石灰9份、多菌靈1份與適量水混合洗刷霉菌處。用5%的石灰水浸泡霉菌，待霉菌消失后排除石灰水，補上新料。用1∶200克霉靈溶液注射料袋內的綠霉或洗刷床面綠霉。用1∶800苯菌靈溶液噴灑料袋霉菌處。在霉菌處涂刷95%的酒精或煤油，點火燒掉，然后挖除，填補新料。用3%的來蘇兒溶液噴灑霉菌處，洗擦工具后將霉菌挖掉，每挖1次將工具洗擦1次，挖除后填補培養料和菌種。此法可徹底根治晚期霉菌。生料栽培時，每100公斤培養料中添加克霉靈100克，可徹底根除霉菌。