番茄苗期病害主要有猝倒病、立枯病兩種：

　　猝倒病：主要癥狀是莖基部出現水漬狀病斑，很快變成黃褐色，病部縊縮呈線狀，病害發展迅速，濕度大時，成片幼苗猝倒。病苗殘體表面及附近床面上長出白色絮狀菌絲。

　　立枯病：主要癥狀莖基部產生褐色橢圓形病斑，發病初期白天萎蔫，晚上恢復正常，病部有輪紋，病斑漸凹陷，擴大到繞莖一周時，基部干縮，但不產生白絮狀霉層，這是與猝倒病的不同之處。