輪作種植造成大蔥根腐爛的關鍵因素是重茬，由于連續多年種植，土壤中病原菌增多，極易造成大蔥根腐死棵，實行輪茬種植，一般三年輪作一次。
防治根蛆定植前先將蔥苗嚴格分級，然后進行藥劑處理，以消滅根蛆，保證全苗。藥劑選用針對性殺菌劑和新高脂膜混合液。
防止積水漚根大蔥葉片水分蒸騰少，根系吸水能力弱，耗水分較少，喜濕怕澇。在生長期間若大水漫灌，容易使大蔥田間積澇成災，發生漚根，干尖，黃葉，死苗現象。解決措施：禁止大水漫灌，要小水勤澆，澆水時結合根施通，促進根系發育，增強根系吸收養份、水份能力。提高吸收水肥的能力。
