一、把好水分關 麥種水分含量大，易發熱，容易導致捂種、霉變，直接影響種子的發芽率和活力。因此在貯藏前要反復晾曬，使麥種水分含量達到安全貯藏的水分，小麥安全貯藏水分為13%以下。
二、把好溫度關 溫度是影響種子新陳代謝的主要因素，貯存的麥種不宜曝曬過度。切忌在水泥地面上曬種，因水泥地面溫度太高，易將種子燒壞；貯存麥種的倉庫溫度最好保持在20℃以下。
三、把好純度關 小麥良種要單收、單打、單曬、單獨貯存。貯存時防止與其它種子混淆，要標上品種名稱。要一個容器盛放一個品種，不能與普通麥子同存一處；晾曬時要單場單曬，不要與其他品種和普通麥子同曬一場，以防混雜。
四、把好濕度關 麥種在高溫高濕環境中，增強了種子的呼吸作用，微生物極易在糧食堆內繁殖，引起麥種發熱霉變，喪失種用能力。而麥種貯藏期，正值高溫高濕多雨季節。因此，麥種要存放在干燥通風處，盛麥種的容器底部要用木板、石塊等防潮物鋪墊。在貯存過程中應經常晾曬，適時通風換氣。
五、把好防鼠防蟲關 農戶貯存麥種數量不大，選用水泥缸，瓷缸貯藏，可起到防鼠防蟲的作用。麥種晾曬后趁熱貯藏，可減少蟲害。防治老鼠、害蟲，惟一的方法是采用藥劑防治，其特效藥是民用磷化鋁，可防治玉米象（油子）、鋸谷盜等糧食害蟲，每200公斤麥種用藥一片，用布包好放入種子內33厘米左右，密封7天即可殺死害蟲。
六、把好存放關 麥種不能用塑料帶貯藏，塑料袋不透氣，妨礙種子呼吸，降低發芽率，同時多于的水分散發不出去，容易引起種子霉變；為防止煙火熏烤，導致種子泛色，水分減少，甚至發熱，不能存放在廚房；不要與碳銨、尿素等氨態氮肥混存在一室，由于這期間溫度高，濕度大，這些氨態氮肥揮發性極強，揮發的氨氣會腐蝕種子細胞和種胚，嚴重影響發芽率和種子活力。
