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《中國科學報》:棉花基因組學研究獲重大進展

放大字體  縮小字體 發布日期:2012-09-11  來源:中國科學報  作者:黃明明  瀏覽次數:70
 

二倍體棉花—雷蒙德氏棉全基因組圖繪制完成

     本報安陽9月7日訊(xun)(記者(zhe)黃明明)記者(zhe)今天從河南省安陽市召開的“二倍(bei)體(ti)棉(mian)花(hua)—雷蒙(meng)(meng)德(de)氏棉(mian)全基因(yin)組(zu)(zu)圖繪(hui)制完(wan)成(cheng)”新聞發布會上獲悉(xi),在中國(guo)(guo)農業科(ke)學(xue)院棉(mian)花(hua)研(yan)究(jiu)所(suo)的主持下,深圳華(hua)大(da)基因(yin)研(yan)究(jiu)院、北京大(da)學(xue)、美國(guo)(guo)農業部南方平原研(yan)究(jiu)中心、哥本哈根大(da)學(xue)、荷蘭(lan)瓦赫寧根大(da)學(xue)等單位共(gong)同合作完(wan)成(cheng)了二倍(bei)體(ti)棉(mian)花(hua)—雷蒙(meng)(meng)德(de)氏棉(mian)的全基因(yin)組(zu)(zu)草圖。日前,研(yan)究(jiu)成(cheng)果以《二倍(bei)體(ti)棉(mian)花(hua)—雷蒙(meng)(meng)德(de)氏棉(mian)的基因(yin)組(zu)(zu)草圖》為(wei)題在線發表于國(guo)(guo)際學(xue)術(shu)期刊(kan)《自然(ran)—遺傳學(xue)》。

     業(ye)內專(zhuan)家表(biao)示,該成(cheng)果將對棉花(hua)基(ji)礎研(yan)究和應用研(yan)究發揮巨大的(de)推動作用,為我國棉花(hua)重要功(gong)能基(ji)因挖掘與利用、分子育(yu)(yu)種,乃至(zhi)全基(ji)因組設(she)計育(yu)(yu)種提(ti)供前所未(wei)有的(de)機(ji)遇。

     據(ju)了解(jie),棉(mian)(mian)花除作為全球重要的(de)經濟作物之外,還是(shi)一種研究多倍體化、細(xi)胞伸長和細(xi)胞壁(bi)生物合成極(ji)好的(de)模(mo)式(shi)系統(tong)。雷蒙德氏棉(mian)(mian)是(shi)現在陸(lu)地棉(mian)(mian)祖先的(de)兩個供體種之一,該棉(mian)(mian)花基(ji)(ji)因(yin)(yin)草圖的(de)完成,為進一步解(jie)析陸(lu)地棉(mian)(mian)全基(ji)(ji)因(yin)(yin)組序(xu)列奠定(ding)了堅實的(de)基(ji)(ji)礎(chu)。

     研究(jiu)(jiu)團隊采用全基(ji)因組(zu)鳥槍法結(jie)合新一代的高(gao)通(tong)量(liang)DNA測序(xu)技術,對雷蒙德氏棉進行了(le)(le)(le)全基(ji)因組(zu)測序(xu),獲得了(le)(le)(le)其(qi)87.7%的全基(ji)因組(zu)序(xu)列。研究(jiu)(jiu)結(jie)果(guo)證明,棉花基(ji)因組(zu)經(jing)歷了(le)(le)(le)真(zhen)雙(shuang)子(zi)葉植物共同(tong)經(jing)歷的一次(ci)(ci)古六倍(bei)化事(shi)件(jian)(jian)和一次(ci)(ci)棉屬特(te)異的全基(ji)因組(zu)復制事(shi)件(jian)(jian),表明了(le)(le)(le)其(qi)古多倍(bei)體(ti)起源。

     此外,研究人(ren)員(yuan)推(tui)測雷蒙德(de)氏棉基(ji)(ji)(ji)因(yin)組(zu)約包含40976個蛋白質編(bian)碼基(ji)(ji)(ji)因(yin),并從基(ji)(ji)(ji)因(yin)組(zu)注釋結(jie)果中發(fa)現了2706個轉錄因(yin)子,其(qi)中大量的(de)MYB和bHLH基(ji)(ji)(ji)因(yin)在花后(hou)0天(tian)和3天(tian)的(de)胚珠中表達。該結(jie)果暗示這些基(ji)(ji)(ji)因(yin)可能為早期纖(xian)維發(fa)育所必需。

 
 
 
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