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首款國產固相育種芯片“華麥芯65K”發布

放大字體  縮小字體 發布日期:2024-05-16  來源:農民日報·中國農網  作者:龐斌雙 劉麗華 記者 蘆曉春  瀏覽次數:342
 
  近日,國內首款具備完全自主知識產權的高密度固相小麥育種芯片——“華麥芯”普通小麥基因分型65K芯片(簡稱“華麥芯65K”)發布,由北京市農林科學院雜交小麥研究所種子檢測研究室(“北京小麥種子檢測中心”)牽頭聯合蘇州拉索生物芯片科技有限公司、中國農業大學、西北農林科技大學等單位研發。這一突破性品種對提升我國小麥品種創新、知識產權保護和種子質量控制具有重要意義。
 
  據悉,“華麥芯65K”嚴格遵照《小麥品種真實性鑒定SNP標記法》(NY/T4021-2021),囊括真實性鑒定和已知品種高密度指紋數據庫構建的所有位點,并整合轉基因檢測所必需的特定標記物,以及部分與小麥產量、品質、抗病等功能基因或緊密連鎖的SNP標記。以中國春2.1版本為參考,目前包含54993個精選的SNP標記(可根據未來研究重要結果擴充至65K),覆蓋196個性狀相關標記。SNP位點在A、B、D染色體上分布較均衡,多態性位點占比高達99.1%,具備良好的區分能力和穩定性;單個SNP位點采用15~30個微球重復檢測,平均檢出率高達99.0%,再現性高達99.5%。
 
  “華麥芯65K”具有五個突出優勢:一是全自主。從芯片制備到掃描儀、試劑、配套軟件及算法在內的一體化解決方案均可自主實現。二是可擴充。可根據需要在原有芯片基礎上隨時添加新的檢測位點,無需重新定制新的芯片,靈活性高、可塑性強。三是多效用。該芯片集背景篩選、品種鑒定、轉基因檢測等多用途于一體,可實現一站式全面篩查,大幅提高檢測效率,并節約成本。四是低成本。固相芯片在規模化檢測時展現出顯著的成本效益。隨著樣本數量增加,單個樣本的檢測成本呈下降趨勢,經濟效益明顯。五是高效率。固相芯片以固態基底上的寡核苷酸探針為基礎,無需依賴測序或其他基因分型技術,即可一次性并行檢測數十萬至數百萬個SNP位點,從檢測到數據分析,整個過程僅需72小時,且準確率保持在99%以上。24個樣本即可完成檢測,無需湊樣。
 
  該芯片的成功研發,有效解決了國外固相芯片技術壟斷“卡脖子”問題,實現了我國高密度固相育種芯片從0到1的突破,將為我國小麥育種創新發展提供重要支撐。
 
 
 
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