20日，記者從中國農業科學院獲悉，該院鄭州果樹研究所草莓種質改良團隊聯合深圳農業基因組研究所共同發布八倍體草莓端粒到端粒基因組，系統解析了八倍體草莓亞基因組結構和遺傳分化，并解析了亞基因組的表觀遺傳進化機制。相關成果日前發表于國際期刊《園藝研究》。

 

 

      紅顏草莓是我國主栽品種之一，其品質優良、豐產性強、商品性好，但對炭疽病、白粉病等抗性差，嚴重制約草莓產業的健康發展。

 

      論文通訊作者、中國農業科學院鄭州果樹研究所研究員周厚成介紹，栽培草莓是復雜的八倍體植物。該研究以紅顏草莓為材料，從頭組裝八倍體草莓端粒到端粒基因組，鑒定出包含ABCD四個亞基因組共109320個基因。通過構建系統進化樹，發現B、C和D亞基因組來源于同一祖先或祖先近緣種，C和D亞基因組最先被引入到八倍體基因組中，A亞基因組是最后的直接祖先供體。分析表明，A亞基因組CG、CHG和CHH甲基化水平最低。亞基因組A偏向表達基因高于其他亞基因組，且A偏向表達同源基因多為基因體甲基化。該研究為后續開展草莓基因功能挖掘、抗性分子育種和品質改良提供了理論和數據支撐。

 

 

紅顏草莓T2T基因組和表觀遺傳。

 

      中國農業科學院鄭州果樹研究所助理研究員宋艷紅和深圳農業基因組所博士后彭艷玲為論文共同第一作者，周厚成和中國農業科學院深圳農業基因組所研究員周永鋒為共同通訊作者。

 

      （中國農業科學院鄭州果樹研究所供圖）