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陸地棉基因組圖譜繪制完成

放大字體  縮小字體 發布日期:2015-06-09  來源:  作者:黃哲雯  瀏覽次數:88
 

      本報訊 (記者黃哲雯)中國農科院棉花研究(jiu)所牽頭(tou)主持,聯合北京大學(xue)、深圳華大基(ji)因、美國農業部南方平原研究(jiu)中心等單位(wei),日前共同完成了世界上廣泛栽(zai)培的(de)(de)陸地棉的(de)(de)全(quan)基(ji)因組(zu)測序及圖譜繪制,在(zai)基(ji)因組(zu)學(xue)研究(jiu)領域取(qu)得(de)突破性成果。

      異源四(si)倍(bei)(bei)體(ti)物(wu)(wu)種(zhong)(zhong)陸地棉(mian)(mian)是(shi)世界上最重(zhong)(zhong)要的(de)纖維作物(wu)(wu)和(he)模式多倍(bei)(bei)體(ti)作物(wu)(wu)。棉(mian)(mian)屬包(bao)(bao)括46個(ge)二倍(bei)(bei)體(ti)和(he)5個(ge)四(si)倍(bei)(bei)體(ti)棉(mian)(mian)種(zhong)(zhong),所(suo)有的(de)二倍(bei)(bei)體(ti)棉(mian)(mian)種(zhong)(zhong)均來自同一(yi)祖先(xian),經演(yan)化形(xing)成了(le)A、B、C、D、E、F、G和(he)K基因(yin)(yin)(yin)組(zu)(zu),四(si)倍(bei)(bei)體(ti)棉(mian)(mian)種(zhong)(zhong)的(de)基因(yin)(yin)(yin)組(zu)(zu)類(lei)型為AD。目前(qian)認為,AD基因(yin)(yin)(yin)組(zu)(zu)是(shi)由A基因(yin)(yin)(yin)組(zu)(zu)祖先(xian)與D基因(yin)(yin)(yin)組(zu)(zu)祖先(xian)雜交后染(ran)色體(ti)加(jia)倍(bei)(bei)而形(xing)成的(de),其(qi)中就包(bao)(bao)括陸地棉(mian)(mian)。高質量(liang)組(zu)(zu)裝異源多倍(bei)(bei)體(ti)植(zhi)物(wu)(wu)基因(yin)(yin)(yin)組(zu)(zu)是(shi)一(yi)個(ge)艱難的(de)任務,因(yin)(yin)(yin)為這種(zhong)(zhong)基因(yin)(yin)(yin)組(zu)(zu)比較(jiao)大(da),包(bao)(bao)含(han)大(da)量(liang)的(de)重(zhong)(zhong)復序列和(he)高度同源的(de)亞(ya)基因(yin)(yin)(yin)組(zu)(zu)。

      在該研究中,科研人員對陸地棉遺傳標準系(xi)—TM-1進行了(le)全基因組(zu)測(ce)序(xu)和組(zu)裝,最終獲得了(le)26條染(ran)色(se)體;通過(guo)基因組(zu)注釋,得到了(le)76943個蛋白編碼(ma)基因;利用比較基因組(zu)學方法(fa),首次從全基因組(zu)水(shui)平揭(jie)示(shi)了(le)四倍體棉花是(shi)由A基因組(zu)的祖先和D基因組(zu)的祖先通過(guo)染(ran)色(se)體融合而形成,并(bing)初步揭(jie)示(shi)了(le)四倍體棉花基因組(zu)的進化(hua)規律。

      據該項目的主(zhu)要(yao)(yao)負責人(ren)李(li)付(fu)廣研究員(yuan)介紹,我國是世(shi)界上最大的紡(fang)織(zhi)品生產國和消費國,在國民經濟中具有(you)十分(fen)重要(yao)(yao)的地位。四倍體棉(mian)花(hua)-陸地棉(mian)(AD組)基(ji)因組圖譜繪制完(wan)成,將加快棉(mian)花(hua)新品種的選育,對(dui)我國棉(mian)花(hua)產業(ye)的可持續發(fa)展(zhan)具有(you)重要(yao)(yao)意義。

 
 
 
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