農業部前不久公布2012年推介的28個主導玉米品種，占據國內玉米種植面積靠前的鄭單958和浚單20等均在推薦之列，而種植面積排名第二的先玉335與去年遭遇的境遇一樣——再次被排除在外，農業部此舉再次引起業內外人士的“議論”。
2005年，農業部制定出臺《農業主導品種和主推技術推介發布辦法》，之后開始每年定期向各省農業部門推薦主導糧食品種，按照農業部科教司技術推廣處工作人員的說法，農業部選定推介的品種主要是看“推廣面積、增產潛力和優質高產等方面”，“先玉335”在2010年就上升至全國玉米種子銷售量的第二位，但之后連續兩年都沒進入農業部推薦的主導品種之列。
去年農業部公布推薦的玉米主導品種之后，業內對“先玉335”沒有入選曾有多種說法，有的認為可能是因為社會上一直盛傳“先玉335”是轉基因品種，有的認為“可能因為‘先玉335’是涉外品種”，而農業部科教司技術推廣處工作人員則表示，“先玉335”落選“有一些特別的原因”，具體是何種“特別原因”，“涉及具體工作層面，不方便透露”。
對于“先玉335”涉嫌是轉基因品種的質疑，去年農業部聯合多部委深入多省調查，最后證實“先玉335”并非轉基因品種，有種業專家表示，“先玉335”為農民增產增收又受農民歡迎，為什么農業部不予推介？如果是因為“先玉335”是“涉外品種”，為什么今年農業部推介的玉米品種也有外國公司培育的“正大619”？這就難免就又回到去年業界熱議的先玉335是“蟲子不吃”，導致很多地方“雞不下蛋”、“母豬流產”的老問題上了。
前述種業專家還表示，在農業部今年主推的28個玉米品種中，北京市農林科學院玉米研究中心選育的品種就占了3個，他舉例說，像北京市農林科學院玉米研究中心選育的“京科968”，目前并有什么大面積推廣的依據，他質疑其中“另有隱情”。
