麥套棉的田間管理，總的要求是苗期促早發、中期保穩長、后期防晚熟。具體管理措施可以概括為三防、四搶、五注意。
一、麥收前抓三防
一是防缺苗斷壟。棉花播種后，及時檢查出苗情況，發現缺苗，及時補齊。麥收前適時澆水，防止干旱死苗。二是防蟲害。麥收前易發生地老虎危害，可取90％的晶體敵百蟲1公斤，先用少量熱水溶化后再加水10公斤，均勻地噴灑在100公斤炒香的餅粉或麥麩上，于傍晚撒在田間誘殺地老虎，每畝2．5～3公斤，防治效果良好。三是防小老苗。結合澆水，及時追施適量氮肥，促棉苗早發。
二、麥收后抓四搶
一是搶滅茬。麥收后及時滅茬，以破除板結，促進棉苗生長和根系發育。二是搶追肥。麥收后追肥要早，一般滅茬后緊接著進行，每畝施尿素2．5～5公斤，施肥量不可過大，以防棉苗旺長。三是槍澆水。施肥后要澆透提苗發棵水，以利棉苗生長和吸收土壤養分。四是搶治蟲。麥收后常有玉米螟從麥株向棉花轉移鉆稈危害，小麥要做到隨割隨運。當棉花有1％被玉米螟鉆稈時，可用久效磷5～10倍液涂莖防治，或撒毒土形成保護帶（用100毫升有機磷或菊酯類農藥噴灑若25～30公斤細土上，然后撒在棉苗根際），防止玉米螟由麥株向棉苗轉移。
三、五注意
一是注意合理施肥。麥套棉要早施、重施花鈴肥，一般可在棉花初花期畝施尿素10～15公斤；為防止晚熟，麥套棉不宜施蓋頂肥。在缺磷地塊，可在8月用磷酸二氫鉀或磷酸二銨300～500倍液進行根外追肥，每10～15天噴一次，共噴2～3次，每畝每次噴施50～75公斤。二是注意合理化控。在棉花盛蕾、初花期主莖日增長量超過3厘米時，每畝可用矮壯素1～1．5毫升或助壯素3～4毫升，對水15公斤左右進行噴施。三是注意適時打頂。適宜的打頂時間，麥套春棉為7月15～20日，麥套夏棉為7月20～25日；8月10～15日要去掉全部無效花蕾。四是注意在棉花盛花期培土，以防澇、防倒伏。五是注意及時治蟲。麥套棉第二、三代棉鈴蟲和伏蚜危害較重，當百株棉花有初孵棉鈴蟲幼蟲5頭時，要及時防治；當棉花卷葉株率達到5％時，要及時防治伏蚜。
