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即生物有機肥的菌種，用以把有機固體廢物（包括有機垃圾、秸稈、畜禽糞便、淤泥、糟渣、餅粕、農副產品和食品加工產生的固體廢物）經發酵、除臭和完全腐熟后加工而成的有機肥料。 生物有機肥的種類：
農家肥：堆肥，沼渣等。
商品生物有機肥：商品化生產的生物有機肥。即農家肥商品化生產后的產物。
微生物有機肥：用微生物菌劑做功能菌的生物有機肥，如菌堅強菌種復配的有機肥. 生物有機肥的優點：
1 生物有機肥與化肥相比：
1） 生物有機肥營養元素齊全；化肥營養元素只有一種或幾種。
2） 生物有機肥能夠改良土壤；化肥經常使用會造成土壤板結。
3） 生物有機肥能提高產品品質；化肥施用過多導致產品品質低劣。
4） 生物有機肥能改善作物根際微生物群，提高植物的抗病蟲能力；化肥則是作物微生物群體單一，易發生病蟲害。
5） 生物有機肥能促進化肥的利用，提高化肥利用率；化肥單獨使用易造成養分的固定和流失。
2 生物有機肥與精制有機肥相比:
精制有機肥是畜禽糞便經過烘干、粉碎后包裝出售的商品有機肥。
1）生物有機肥完全腐熟，不燒根，不爛苗；精制有機肥未經腐熟，直接使用后在土壤里腐熟，會引起燒苗現象。
2）生物有機肥經高溫腐熟，殺死了大部分病原菌和蟲卵，減少病蟲害發生；精制有機肥未經腐熟，在土壤中腐熟時會引來地下害蟲。
3）生物有機肥中添加了有益菌，由于菌群的占位效應，減少病害發生；精制有機肥由于高溫烘干，殺死了里面的全部微生物。
4）生物有機肥養分含量高；精制有機肥由于高溫處理，造成了養分損失。
5）生物有機肥經除臭，氣味輕，幾乎無臭；精制有機肥未經除臭，返潮即出現惡臭。
3 生物有機肥與農家肥的區別：
1）生物有機肥完全腐熟，蟲卵死亡率達到95%以上；農家肥堆放簡單，蟲卵死亡率低。
2）生物有機肥無臭；農家肥有惡臭。
3）生物有機肥施用方便，均勻；農家肥施用不方便，肥料施用不均勻。
4 生物有機肥與生物菌肥的區別：
1）生物有機肥價格便宜，每噸在800元左右；生物菌肥價格昂貴，每噸上萬元。
2）生物有機肥含有功能菌和有機質，能改良土壤促進被土壤固定養分的釋放；生物菌肥只含有功能菌，通過功能菌來促進土壤固定肥料的利用。
3）生物有機肥的有機質本身就是功能菌生活的環境，施入土壤后容易存活；而生物菌肥的功能菌可能不適合有的土壤環境。
生物有機肥生產注意事項
由于原料多采用大糞、植物秸稈等，多含有蟲卵及有害病菌，如果腐熟溫度小于70℃，則這些有害蟲卵和雜菌不會被殺死，作為植物病害誘導的另一種病源。所以，生產生物有機肥時，一定要注意腐熟溫度。最好使用發酵菌，不僅升溫快，而且腐熟效果好，可有效殺滅蟲卵。鄭州瑪斯特科技發展有限公司生產的菌堅強菌種，不僅有發酵菌的作用，還有部分功能菌在防病、防蟲、活化磷鉀方面有比較好效果。