花椒較耐旱，對水分要求不高，過度潮濕極不利于生長，短期積水或沖淤造成板結能使椒樹死亡。一般年降水量500毫米、降雨分布均勻，就可滿足需求。年降水量500毫米以下地區，只要在萌芽前和坐果后各澆1次水，也能滿足正常生長和結果的需要。遇嚴重干旱，花椒葉會發生萎蔫，短期遇水仍能恢復生長。這些特點說明花椒樹對水分的需求量不大，但要集中在生育期內，特別是生長前期和中期。水分過多，易發生病蟲害，且因濕度過大、熱量減少，反而不利于花椒生長與果實膨大成熟，嚴重的甚至造成根系窒息死亡；水分過少，易造成干旱，生長前期影響開花結果造成生理落果，后期果實膨大期不利于物質的積累，易導致減產。特別是4~5月份，進入開花結果期，對水分十分敏感，需水量較多。花椒根淺，因而難以忍耐嚴重干旱，當土壤含水量低于10%時，葉片會嚴重萎蔫，低于6時會導致植株死亡。根系耐水性差，土壤含水量過高、排水不良，會使樹體生長不良甚至死亡。生產中要滿足開花至結果關鍵期的需水要求。